按用途不同劃分發(fā)酵培養(yǎng)基
培養(yǎng)基在實驗室和發(fā)酵生產中按其用途可以有不同的分類方法。
1.實驗室常用培養(yǎng)基
（1）基礎培養(yǎng)基
不同微生物的營養(yǎng)需求各不相同，但大多數微生物所需的基本營養(yǎng)物質致?；A培養(yǎng)基就是含有般微生物生長繁殖所需的基本營養(yǎng)物質的培養(yǎng)基。牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基是常用的基礎培養(yǎng)基，廣泛用于細菌的增菌、檢驗中。
（2）加富培養(yǎng)基
加富培養(yǎng)基也稱營養(yǎng)培養(yǎng)基，即在基礎培養(yǎng)基中加入某些特殊營養(yǎng)物質制成的類營養(yǎng)豐富的培養(yǎng)基，這些特殊營養(yǎng)物質包括血液、血清、酵母浸膏、動植物組織液等。加富培養(yǎng)基般用來培養(yǎng)營養(yǎng)要求比較苛刻的異養(yǎng)型微生物，如培養(yǎng)百日咳博德氏菌（bordetella pertussis）需要含有血液的加富培養(yǎng)基。加富培養(yǎng)基還可以用來富集和分離某種微生物，這是因為加富培養(yǎng)基含有某種微生物所需的特殊營養(yǎng)物質，該種微生物在這種培養(yǎng)基中較其他微生物生長速率快，并逐漸富集而占優(yōu)勢，逐步淘汰其他微生物，從而容易達到分離該種微生物的目的。
（3）鑒別培養(yǎng)基
鑒別培養(yǎng)基是用于鑒別不同類型微生物的培養(yǎng)基。在培養(yǎng)基中加入某種特殊化學物質，某種微生物在培養(yǎng)基中生長后能產生某種代謝產物，而這種代謝產物可以與培養(yǎng)基中的特殊化學物質發(fā)生特定的化學反應，產生明顯的特征性變化，根據這種特征性變化，可將該種微生物與其他微生物區(qū)分井來。鑒別培養(yǎng)基主要用于微生物的快速分類鑒定，以及分離和篩選產生某種代謝產物的微生物菌種。
培養(yǎng)基名稱加入化學物質微生物代謝產物培養(yǎng)基特征性變化主要用途酪素培養(yǎng)基酪素胞外蛋白酶蛋白水解圈鑒別產蛋白酶菌株明膠培養(yǎng)基明膠胞外蛋白酶明膠液化鑒別產蛋白酶菌株油脂培養(yǎng)基（4）選擇培養(yǎng)基
選擇培養(yǎng)基是根據某微生物的特殊營養(yǎng)要求或其對某些物理、化學因素的抗性而設計的培養(yǎng)基，用來將某種或某類微生物從混雜的微生物群體中分離出來，具有使混合菌樣中的劣勢菌變成優(yōu)勢菌的功能，廣泛用于菌種篩選等域。
混合菌樣中數量很少的某種微生物，如直接采用平板劃線或稀釋法進行分離，往往因為數量少而無法獲得。選擇性培養(yǎng)的方法主要有兩種：種是依據某些微生物的特殊營養(yǎng)需求設計選擇培養(yǎng)基。例如，缺乏氮源的選擇培養(yǎng)基可用來分離固氮微生物；利用以蛋白質作為氮源的選擇培養(yǎng)基，可以從混雜的培養(yǎng)基中分離出產胞外蛋白酶的微生物。另種是在培養(yǎng)基中加入某種化學物質，這種化學物質可以抑制或殺死其他微生物，而對所需分離的微生物無害。例如，分離放線菌時，在培養(yǎng)基中加入數滴10%的，可以抑制霉菌和細菌的生長；在分離酵母菌和霉菌的培養(yǎng)基中，添加、四環(huán)素和等抗生素可以抑制細菌和放線菌的生長；在篩選含有重組質粒的基因工程菌株過程中，利用質粒上具有的對某種（些）抗生素的抗性選擇標記，在培養(yǎng)基中加入相應抗生素，就能比較方便地淘汰非重組菌株，以減少篩選目標菌株的工作量。
選擇培養(yǎng)基與鑒別培養(yǎng)基的功能往往結合在同種培養(yǎng)基中。例如上述emb培養(yǎng)基既有鑒別不同腸道菌的作用，又有抑制g+菌和選擇性培養(yǎng)g-菌的作用。
2.發(fā)酵生產常用培養(yǎng)基
（1）孢子培養(yǎng)基
孢子培養(yǎng)基是供菌種繁殖、形成孢子的種常用固體培養(yǎng)基。對這種培養(yǎng)基的要求是能使菌體迅速生長，產生較多優(yōu)質的孢子，并要求這種培養(yǎng)基不易引起菌種變異。因此，孢子培養(yǎng)基的基本配制要求有：，營養(yǎng)不要太豐富（特別是有機氮源），否則不易產孢子。如灰色鏈霉菌在葡萄糖硝酸鹽其他鹽類的培養(yǎng)基上都能很好地生長和產孢子，但若加入0.5%酵母膏或酪蛋白后，就只長菌絲而不長孢子；二，所用無機鹽的濃度要適量，不然也會影響孢子量和孢子顏色；第三，要注意孢子培養(yǎng)基的ph和濕度。生產上常用的孢子培養(yǎng)基有麩皮培養(yǎng)基，小米培養(yǎng)基，大米培養(yǎng)基，玉米碎屑培養(yǎng)基和用葡萄糖、蛋白胨、牛肉高和食鹽等配制成的瓊脂斜面培養(yǎng)基。大米和小米常用作霉菌產孢子培養(yǎng)基，因為它們含氨量少，疏松，表面積大，所以是較好的孢子培養(yǎng)基。大米培養(yǎng)基的水分需控制在21%~50%，而曲房空氣濕度需控制在90%~。
（2）種子培養(yǎng)基
種子培養(yǎng)基是供孢子發(fā)芽、生長和大量繁殖菌絲體，并使菌體長得粗壯、成為活力強的“種子”的營養(yǎng)基質。因此，種子培養(yǎng)基的營養(yǎng)成分要求比較豐富和，氮源和維生素的含量也要高些，但總濃度以略稀為好，這樣可有較高的溶解氧，供大量菌體生長繁殖。種子培養(yǎng)基在微生物代謝過程中能維持穩(wěn)定的ph，其組成還要根據不同菌種的生理特征而定。般種子培養(yǎng)基都用營養(yǎng)豐富而的天然有機氮源，因為有些氨基酸能刺激孢子發(fā)芽，但無機氮源容易較快被利用，有利于菌體迅速生長，所以在種子培養(yǎng)基中常包括有機及無機氮源。后的種子培養(yǎng)基的成分好能較接近發(fā)酵培養(yǎng)基，這樣可使種子進入發(fā)酵培養(yǎng)基后能迅速適應，快速生長。
（3）發(fā)酵培養(yǎng)基
發(fā)酵培養(yǎng)基是供菌種生長、繁殖和合成產物之用。它既要使種子接種后能迅速生長，達到定的菌絲濃度，又要使長好的菌體能迅速合成所需產物。因此，發(fā)酵培養(yǎng)基的組成除有菌體生長所必需的元素外，還要有合成產物所需的特定元素、前體和促進劑等。當菌體生長和產物合成所需要的總的碳源、氮源、磷源等的濃度過高，或生長和合成兩階段各需的佳條件要求不同時，可考慮用分批補料的方式來加以滿足。
按微生物種類不同劃分培養(yǎng)基根據微生物的種類不同可分為細菌培養(yǎng)基、放線菌培養(yǎng)基、酵母菌培養(yǎng)基和霉菌培養(yǎng)基等。
常用的異養(yǎng)型細菌培養(yǎng)基為牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基；常用的自養(yǎng)型細菌培養(yǎng)基是無機的合成培養(yǎng)基；常用的放線菌培養(yǎng)基為高氏號合成培養(yǎng)基；常用的酵母菌培養(yǎng)基為麥芽汁培養(yǎng)基；常用的霉菌培養(yǎng)基為察氏合成培養(yǎng)基和馬鈴薯蔗糖培養(yǎng)基。